תוכנית התואר השני בממשל ומדיניות ציבורית מציעה גם מסלול מחקרי שכולל כתיבת תזה. התזה היא תנאי ללימודי תואר שלישי (דוקטורט). כל הסטודנטים בתכנית מתחילים את לימודיהם במסלול ללא תזה והמעבר למסלול עם תזה נעשה בהתאם לשלבים המפורטים להלן. יש להשלים בהצלחה כל שלב לפני שניתן לעבור לשלב הבא:
לעבור בהצלחה את הסמינר המתודולוגי לכתיבה מחקרית (קורס מס' 12190)[*] בציון של 80 ומעלה, ולקבל המלצה ממרצה הסמינר.
שימו לב כי מומלץ מאוד להגיע לסמינר עם הנושא שעליו תרצו לכתוב את התזה
במקרה של הפסקת הלימודים במסלול עם התזה ומעבר למסלול ללא תזה, הסמינר המתודולוגי יוכר כקורס בחירה.
[*] היה ולא ימשיך הסטודנט למסלול עם תזה, מכל סיבה שהיא, יוכר לו הסמינר המתודולוגי כקורס בחירה במסלול ללא תזה.
הגשת הצעה לועדת התזה באישור המנחה, בצירוף מכתב מועמדות לקבלה למסלול עם תזה. ועדת התזה בראשות ראש התוכנית לתואר שני תדון בהצעה. אל הדיון יוזמנו גם הסטודנט ומנחה העבודה. בשיקוליה תיתן הוועדה משקל מרבי להישגים בקורסים המתודולוגיים והיא זו שתקבע את התנאים ללימוד במסלול. רק לאחר אישור הצעת התזה על ידי המנחה והוועדה, יעברו המועמדים והמועמדות למעמד "מן המניין" במסלול.
בהמלצת המנחה, ועדת התזה תקבע איזה קורס מתודולוגי שני נדרש להמשך הלימודים - שיטות מחקר איכותניות (תואר שני) (14210) או סטטיסטיקה ושיטות מחקר מתקדמות א (14301). בהמלצת המנחה, רשאית הועדה להעניק פטור מלימודי קורס מתודולוגי שני. אם ניתן פטור, יוצע קורס בחירה במקום הקורס המתודולוגי השני.
הזמן המוקצב לכתיבת התזה הוא שנתיים מיום אישור ההצעה. יש להשלים בזמן זה את יתר החובות לתואר השני:
הנחיות כלליות להצעת תזה בממשל ומדיניות ציבורית
הנחיות וטפסים לקבלת אישור של ועדת האתיקה המחקרית המחלקתית
הגשת התזה ובדיקתה - הנחיות
טופס אישור מנחה להצעת תזה
טופס אישור נושא לעבודת תזה
טופס אישור קבלת עותקים של התזה בספריית האו"פ